Аналіз генетичного поліморфізму за локусами мікросателітів худоби південної м’ясної породи

Abstract

Проведено аналіз рівня генетичного поліморфізму худоби південної м’ясної породи (два підтипи) на підставі панелі 12 мікросателітів, затверджених ISAG (Міжнародне Товариство з генетики тварин). Встановлено високий рівень поліморфізму за локусами мікросателітів для досліджених тварин. Для певних локусів відмічено значне відхилення від стану генетичної рівноваги, що обумовлено значною нестачею гетерозигот

Проведен анализ уровня генетического полиморфизма южной мясной породы скота (два подтипа) на основе панели 12 микросателлитов, утвержденной ISAG (Международное общество по генетике животных). Установлен высокий уровень полиморфизма по локусам микросателлитов для исследованных животных. Для отдельных локусов отмечено существенное отклонение от состояния генетического равновесия, обусловленное существенным дефицитом гетерозигот.

To determine the genetic status of the Southern Meat Cattle breed, the variability of individuals of the “Santa Gertrudis”-liked and the “Zebu”-liked subpopulations was determined using ISAG-sanctioned 12 microsatellite markers bovine panel. Measures of genetic variation including observed and effective number of alleles and their frequencies, observed and expected heterozygosity and HWE deviation per loci were calculated using GeneAIex and GENEPOP softwares. The panel of 12 markers showed 8.83 and 9.08 alleles per locus for cows different lineages, which suggests that these markers are highly polymorphic. A total of 124 alleles were detected across the 12 loci analyzed. The highest and lowest number of alleles was observed for TGLA227 locus and TGLA126 loci, respectively. In the present study, the highest and lowest value of observed heterozygosity was for the BM1818 and ETH225 loci (0.867 and 0.167, respectively) for the “Santa Gertrudis”-liked cows and for the TGLA126 and ETH225 loci (1.00 and 0.250, respectively) for the “Zebu”-liked ones. The number of private alleles found was 15 in the “Santa Gertrudis”-liked subpopulation and 18 in the “Zebu”-liked subpopulation. There were a total of 24 HWE tests (12 loci in 2 populations). A total of 9 locus-population combinations were statistically significant (p < 0.05). These deviations comprise 5 loci the “Santa Gertrudis”-liked cows and 4 loci in the “Zebu”-liked ones. Nonsignificant deviations from HWE were observed for BM2113, ETH10, TGLA122, INRA23, TGLA126, BM1818 and BM1824 loci.