Genetic structure of different equine breeds by microsatellite DNA LOCI

Abstract

Our work was aimed at the evaluation of genetic diversity of three domestic equine breeds which differ by the history of their formation and use. Methods. Genotyping of DNA samples of three breeds of horses, namely, Hucul (78 animals), Thoroughbred (51 animals) and Ukrainian Saddle Horse (152 animals), was conducted by 11 microsatellite loci, recommended by the International Stud Book Committee (ISBC) and the International Society for Animal Genetics (ISAG). The mathematical analysis involved parametric and non-parametric methods of statistics. Results. The results of polymorphism analysis of the gene funds for Hucul, Thoroughbred and Ukrainian Saddle horses by 11 microsatellite DNA loci were first presented in Ukraine. It was demonstrated that the study of microsatellite DNA loci allows both determining the reliability of origin of pedigree animals and controlling population processes in different breeds and the polymorphy of the very breeds. Conclusions. The molecular and genetic analysis of equine breeds, differing by their provenance, demonstrated specificities of genetic structure of each breed, which correspond to the formation history of their gene funds. The populational-genetic analysis using different mathematical methods is recommended for the purposes of evaluating and forecasting microevolution processes, controlling gene fund formation both during the breeding work and within the system of preserving genetic biodiversity

Метою нашої роботи була оцінка генетичного різноманіття трьох порід свійських коней, що відрізняються як історією формування так і використання. Методи. Генотипування зразків ДНК трьох порід коней, а саме: гуцульської (78 гол.), англійської чистокровної (51 гол.) та української верхової (152 гол.), здійснювали за 11 мікросателітними локусами, рекомендованими Міжнародним комітетом з племінних книг (ISBC) та Міжнародним товариством з генетики тварин (ISAG). Для математичного аналізу було використано параметричні і непараметричні методи статистики. Результати. Вперше в Україні наведено результати аналізу поліморфізму генофондів коней гуцульської, англійської чистокровної та української верхової порід за 11 мікросателітними локусами ДНК. Продемонстровано, що дослідження мікросателітних локусів ДНК дає можливість не лише визначати достовірність походження племінних тварин, а й дає дозвіл здійснювати контроль популяційних процесів в різних породах та поліморфність самих порід. Висновки. В результаті проведення молекулярно-генетичного аналізу різних за історією походження порід коней встановлено специфічні особливості генетичної структури кожної з порід, які відповідають історії формування їхніх генофондів. Популяційно-генетичний аналіз за використання різних математичних методів рекомендовано з метою оцінювання і прогнозування мікроеволюційних процесів, контролю формування генофондів, як у процесі проведення селекційної роботи, так і в системі збереження генетичного біорізноманіття .