Поліморфізм за геном прогестеронового рецептора (PGR) та його зв’язок із багатоплідністю у кролиць каліфорнійської породи

Abstract

Сучасні генетичні підходи до вдосконалення порід засновані на поглибленій оцінці генотипу сільськогосподарських тварин і генетичного різноманіття популяцій за допомогою маркерних технологій. Визначення генотипів тварин було прове- дено за допомогою методу ПЛР-ПДРФ. Ділянку довжиною 558 п.н. промоторного регіона гена прогестеронового рецептора (PGR) було досліджено у 60 особин каліфорнійської породи із груп з високим та низьким рівнем багатоплідності. Встановлено, що у особин із групи багатоплідних кролиць переважали особини із гетерозиготним генотипом (0,700), тим часом як серед тварин із низькими показниками багатоплідності – особини із генотипом АА. Крім того, кролиці І-ої групи характеризувалися дуже високим рівнем фактичної гетерозиготності (Ho = 0,700), що значно переважає очікувану гетерози-готність (Не = 0,455). Серед тварин, що мали низький рівень багатоплідності, відмінності між оцінками фактичної та очікуваної гетерозиготності менш суттєві (0,400 та 0,320, відповідно). Таким чином, в обох групах спостерігається надлишок гетерозиготності, що супроводжується негативними оцінками індексу фіксації. Використання вметоду ПЛР-ПДРФ для гена PGR (рестриктаза Eco31I) дозволило встановити два генотипа AA та GA; генотип АА мав один бенд довжиною 558 п.н., а гетерозиготний генотип GA – три бенда довжиною 558, 416 та 112 п.н. Було відмічено наявність поліморфізму 2464G > A для гена PGR кролиць із різних груп; частота алеля G складала 0,350 у тварин із високим рівнем багатоплідності та 0,200 – із низьким. Незалежно від групи, відмічається переважання за кількістю отриманих кроленят для кролиць генотипу GA над особинами, що мали генотип АА. Більш суттєвою ця різниця була для кролиць із І-ої групи (9,1 та 7,0 кроленят відповідно). Встановлено різницю за рівнем багатоплідності для тварин із генотипами AA та GA із груп як багато-, так і малоплідних кролиць.

Современные генетические подходы к совершенствованию пород основаны на углубленной оценке генотипа сельскохозяйственных животных и генетического разнообразия популяций с помощью маркерных технологий. Определение генотипов животных было проведено с помощью метода ПЦР-ПДРФ. Участок длиной 558 п.н. промоторной региона гена прогестеронового рецептора (PGR) было исследовано в 60 особей калифорнийской породы из групп с высоким и низким уровнем многоплодия. Установлено, что у особей из группы многоплодных крольчих преобладали особи с гетерозиготным генотипом (0,700), тогда как среди животных с низкими показателями многоплодия – особи с генотипом АА. Кроме того, крольчихи I-й группы характеризовались очень высоким уровнем фактической гетерозиготности (Ho = 0,700), что значительно превышает ожидаемую гетерозиготность (Не = 0,455). Среди животных которых имели низкий уровень многоплодия, различия между оценками фактической и ожидаемой гетерозиготности менее существенные (0,400 и 0,320 соответственно). Таким образом, в обеих группах наблюдается избыток гетерозиготности, что сопровождается негативными оценками индекса фиксации. Использование метода ПЦР-ПДРФ для гена PGR (рестриктаза Eco31I) позволило установить два генотипа AA и GA; генотип АА имел один бэнд длиной 558 п.н., а гетерозиготный генотип GA – три бэнда длиной 558, 416 и 112 п.н. Было отмечено наличие полиморфизма 2464G > A для гена PGR крольчих из разных групп; частота аллеля G составляла 0,350 в животных с высоким уровнем многоплодия и 0,200 – с низким. Независимо от принадлежности к группе, отмечается преобладание по количеству полученных крольчат для крольчих генотипа GA над особями, которые имели генотип АА. Более существенной эта разница была для крольчих с I-й группы (9,1 и 7,0 крольчат, соответственно). Установлено разницу по уровню многоплодия для животных с генотипами AA и GA из групп как много-, так и малоплодных крольчих.

Modern approaches to genetic improvement of species based on genotype-depth evaluation of farm animals and genetic diversity of populations using marker technology. Determination of genotype of animals was carried out using PCR-RFLP. A 558-bp sequence of the rabbit progesterone receptor promoter region (PGR) gene was obtained for 60 animals of the California breed from High Litter Size (HLS) and Low Litter Size (LLS) groups. Found that in individuals with multiple groups rabbit dominated by individuals with heterozygous genotype (0.700), while in animals with low levels litter size – individuals with genotype AA. In addition, the rabbit and the second group were characterized by very high actual heterozygosity (Ho = 0,700), which significantly exceeds the expected heterozygosity (No = 0.455). Among the animals that had low bahatoplidnosti differences between actual and expected assessments heterozygosity less significant (0.400 and 0.320, respectively). Thus, in both groups, there is an excess of heterozygosity, accompanied by negative assessments fixation index. PCR-RFLP for PGR gene (using the Eco31I restriction endonuclease) revealed two genotypes of AA and GA, and the genotype AA yielding a single 558 bp band, and the heterozygote genotype GA yielding all the three bands of 558, 416 and 142 bp. The 2464G > A SNP for PGR gene was not fixed in the HLS and LLS groups, the allele G frequency being 0.350 in the HLS and 0.200 in the LLS group. Whatever belong to a group marked predominance on the number of rabbits for a rabbit genotype GA on individuals who had genotype AA. More significant, the difference was for the rabbit of the I-th group (9.1 and 7.0 rabbits, respectively). The difference in litter size between the AA and GA genotypes was found for rabbits from as the HLS, as LLS group.