Генетичний поліморфізм ESR1_intron 3 (PvuII) та його зв’язок із багатоплідністю свиней: мета-аналіз

Abstract

Головною метою даної роботи був мета-аналіз прояву генетичного поліморфізму ESR1_intron 3 (PvuII) та його зв’язку з багатоплідністю свиноматок в різних господарствах України. Для проведення мета-аналізу генетичного поліморфізму ESR1_intron 3 (PvuII) свиней в різних господарствах України, нами було використано процедуру літературного пошуку на підставі пошукової системи Google Академія (https://scholar.google. com.ua/). Всього в аналіз було включено опубліковані раніше дані щодо 25 популяцій свиней в різних господарствах України та одна для дикого кабана. Для визначення міри асоціації між генотипом свиней за поліморфізмом ESR1_intron 3 (PvuII) та відповідними оцінками ознак відтворення свиноматок, було проведено мета-аналіз для трьох попарних порівнянь між субгрупами тварин на підставі їх генотипу: між генотипами АА та АВ, між генотипами АА та ВВ та між генотипами АВ та ВВ. Аналіз розподілу за частотами генотипів поліморфізму ESR1_intron 3 (PvuII) свиней в різних господарствах України свідчить про наявність суттєвої внутрішньо- та міжпородної мінливості серед досліджених тварин. В цілому, для 26-ти включених в аналіз популяцій, середня оцінка частоти алеля В складала 0,328 ± 0,036. При цьому, для тварин великої білої породи вона дорівнювала 0,432 ± 0,048, для тварин породи ландрас – 0,246 ± 0,075, а для тварин української м’ясної породи – 0,336 ± 0,061. Таким чином, була встановлена вірогідна відмінність (P < 0,05) у відношенні частоти алеля В між тваринами великої білої породи та породи ландрас. Встановлено, що переважна кількість досліджених популяцій характеризувалася значними відхиленнями фактичного розподілу генотипів за поліморфізмом ESR1_intron 3 (PvuII) від стану генетичної рівноваги за Гарді-Вайнбергом. З іншого боку, всі включені до аналізу популяції тварин породи ландрас характеризувалися станом генетичної рівноваги за Гарді-Вайнбергом. В цілому, оцінка генетичної диференціації (FST) для 26-ти популяцій свиней різних порід, що було включено до аналізу, була суттєвою (+0,174), що свідчить про значні відмінності у характері розподілу за частотами генотипів АА, АВ та ВВ. Для окремих порід, для яких було можливо отримати дані по різних популяціях, ці оцінки були нижче і коливалися в межах від FST = +0,089 (для популяцій свиней породи ландрас) до FST = +0,118 (для популяцій свиней української м’ясної породи). Результати мета-аналізу, отримані для 8-ми окремих публікацій, свідчать про наявність вірогідного переважання свиноматок, які мали або гетерозиготний генотип АВ, або гомозиготний генотип ВВ, над особинами генотипу АА за поліморфізмом ESR1_intron 3 (PvuII) у відношенні загальної кількості поросят при народженні. При цьому, отримані результати свідчать про відсутність вірогідного зв’язку між генотипом свиноматок за поліморфізмом ESR1_intron 3 (PvuII) та їх багатоплідністю